實時熒光定量PCR儀是分子生物學中一種強大的工具,其用于定量檢測特定DNA或RNA分子的擴增過程的技術。實時熒光定量PCR儀則是執(zhí)行這一技術的平臺,它通過增加一個熒光信號采集系統(tǒng)和計算機分析處理系統(tǒng),實現(xiàn)了對PCR擴增過程的實時監(jiān)控。在擴增時,引物利用同位素或熒光素進行標記,與熒光探針和模板特異性結合進行擴增。擴增信號通過實時采集系統(tǒng)輸送到計算機進行分析處理,最終得出量化的實時結果。
實時熒光定量PCR儀其核心組成部分相互協(xié)作,共同實現(xiàn)核酸的擴增、檢測與數(shù)據(jù)分析。以下是qPCR儀的主要組成部分及其功能詳解:
一、熱循環(huán)系統(tǒng)(Thermal Cycler)
熱循環(huán)系統(tǒng)是qPCR儀的核心模塊,負責精確控制PCR反應的溫度變化,實現(xiàn)DNA的變性、退火和延伸三個關鍵步驟。
溫度控制模塊
半導體加熱/制冷片:通過帕爾貼效應快速升降溫,實現(xiàn)溫度的精確控制(通常精度達±0.1℃)。
溫度傳感器:實時監(jiān)測反應模塊的溫度,反饋至控制系統(tǒng)以調整加熱/制冷功率。
熱蓋:防止反應管頂部冷凝,避免蒸發(fā)導致的體積變化和信號干擾。
反應模塊設計
樣品槽:通常為96孔板、384孔板或單管/8聯(lián)管格式,適配不同實驗規(guī)模。
均勻加熱:通過優(yōu)化熱傳導設計(如金屬塊或硅基材料),確保所有樣品孔溫度一致,減少邊緣效應。
二、光學檢測系統(tǒng)(Optical Detection System)
光學檢測系統(tǒng)負責實時捕獲PCR反應中的熒光信號,并將其轉化為數(shù)字信號供后續(xù)分析。
激發(fā)光源
LED或激光:提供特定波長的激發(fā)光(如488nm用于FAM染料,550nm用于HEX/VIC染料),激發(fā)熒光基團。
多波長設計:支持多種熒光染料(如SYBR Green、ROX、Cy5)的同步檢測,實現(xiàn)多靶標分析。
熒光信號采集
光學濾光片:分離激發(fā)光和發(fā)射光,減少背景噪聲。
光電倍增管(PMT)或CCD相機:高靈敏度檢測熒光信號,支持單孔或整板掃描。
光路設計:采用光纖傳導或共聚焦光學系統(tǒng),提高信號采集效率。
檢測模式
終點法檢測:在PCR反應結束后測量熒光信號,適用于定性分析。
實時動態(tài)監(jiān)測:在每個循環(huán)的延伸階段末采集信號,生成擴增曲線,用于定量分析。
三、控制系統(tǒng)與軟件(Control System&Software)
控制系統(tǒng)與軟件是qPCR儀的“大腦”,負責協(xié)調硬件運行、數(shù)據(jù)采集與分析。
硬件控制
微處理器:執(zhí)行溫度控制程序、光學檢測指令及數(shù)據(jù)傳輸。
用戶界面:觸摸屏或電腦軟件,支持實驗參數(shù)設置(如溫度、時間、循環(huán)數(shù))、運行監(jiān)控及結果導出。
數(shù)據(jù)分析軟件
基線校正:自動扣除背景熒光,修正基線漂移。
閾值設定:根據(jù)噪聲水平確定熒光閾值,計算Ct值(循環(huán)閾值)。
定量分析:通過標準曲線法或比較Ct法(ΔΔCt法)計算靶基因的初始拷貝數(shù)。
熔解曲線分析:針對SYBR Green等染料,通過監(jiān)測熔解溫度(Tm)區(qū)分特異性產物與非特異性產物。
多報告基因分析:支持多通道熒光信號的同步分析,實現(xiàn)基因表達多維度比較。
四、反應體系與耗材(Reaction System&Consumables)
反應體系與耗材是qPCR實驗的物質基礎,直接影響實驗結果。
反應體系組成
模板DNA/RNA:待擴增的核酸樣本。
引物(Primers):特異性結合靶序列的寡核苷酸,定義擴增區(qū)域。
探針(Probes):如TaqMan探針,攜帶熒光報告基團和淬滅基團,實現(xiàn)實時信號檢測。
熒光染料:如SYBR Green,非特異性結合雙鏈DNA,適用于未知序列擴增。
酶制劑:耐熱DNA聚合酶(如Taq酶)、逆轉錄酶(用于RT-qPCR)。
緩沖液與dNTPs:維持反應環(huán)境穩(wěn)定,提供原料。
耗材選擇
反應管:低吸附、耐高溫的聚丙烯管,減少核酸損失。
光學膜:密封反應管,防止蒸發(fā)同時允許熒光透射。
標準品:已知濃度的核酸樣本,用于繪制標準曲線。
五、輔助模塊(Auxiliary Modules)
部分qPCR儀配備輔助模塊,以擴展功能或提升用戶體驗。
梯度PCR功能
通過獨立控制不同區(qū)域的溫度,實現(xiàn)退火溫度的梯度設置,優(yōu)化引物設計。
自動化進樣系統(tǒng)
集成機械臂或液體處理工作站,實現(xiàn)高通量樣本的自動加載與反應體系構建。
遠程監(jiān)控與云平臺
支持實驗數(shù)據(jù)云端存儲與共享,便于多中心協(xié)作與長期追蹤。